Fakultas Teknik Unsrat terbentuk melalui Surat Keputusan Menteri PTIP No. 132 tanggal 22 Oktober 1964, terhitung mulai tanggal 1 September 1964 dinyatakan berdirinya Fakultas Teknik dalam lingkungan Unsulutteng, yang kemudian dikenal dengan nama Universitas Sam Ratulangi, dengan satu jurusan yaitu Jurusan Teknik Sipil. JurusanTeknik Sipil mengadakan program afiliasi dengan Departemen Teknik Sipil ITB di Bandung, dengan mengirimkan mahasiswa melanjutkan studi di ITB sesuai tempat yang tersedia. Program ini berjalan kurang lebih 10 tahun. Kemudian sejak tahun 1980 Fakultas Teknik Unsrat sudah menjalankan program yang menamatkan sendiri lulusannya.
Pada tahun 1976 sangat terasa kebutuhan tenaga madya untuk menjembatani tenaga sarjana dengan para lulusan Sekolah Menengah sebagai pelaksana pembangunan di Sulawesi Utara. Melalui studi kelayakan dan seminar engan beberapa instansi antara lain Kanwil P & K Sulut, PLN dan Dinas PU, dan melalui SK Rektor Unsrat No. 873/UM/thn 1977 tanggal 7 Maret 1977, dibuka Program D-III Pendidikan Ahli Teknik (P.A.T) dengan jurusan Teknik Sipil dan Arsitektur.
Berdasarkan SK Dirjen Dikti No.048/Dikti/Kep/1984 tanggal 18 Juli 1984, Program Studi yang ada di Fakultas Teknik Unsrat menjadi :
1. Program studi S1 Teknik Sipil
2. Program studi S1 Teknik Arsitektur
3. Program studi D-III Teknik Sipil
4. Program studi D-III Teknik Arsitektur
5. Program studi D-III Teknik Mesin
6. Program studi D-III Teknik Elektro
Pada tahun 1998 Fakultas Teknik maju selangkah lagi. Pemerintah menyetujui pengembangan Fakultas Teknik Unsrat, yang tadinya hanya 1 (satu) jurusan yaitu Jurusan Teknik Sipil dengan 3 (tiga) jurusan baru, yaitu : Jurusan Teknik Mesin (SK Dirjen Dikti No.212/DIKTI/Kep/1998 tgl. 3 Juli 1998), dan Jurusan Arsitektur serta Jurusan Teknik Elektro (SK Dirjen Dikti No.457/DIKTI/Kep/1998 tgl. 18 Desember 1998).
Pada tahun 2008, penyelenggaraan Program Studi S1 Perencanaan Wilayah dan Kota mendapat ijin Dirjen Dikti melalui surat No. 842/D/T/2008 tgl. 13 Maret 2008. Dalam pelaksanaannya Program Studi baru ini dikelola oleh Jurusan Arsitektur Fakultas Teknik Unsrat.
Pada tahun 2006 dan tahun 2011 telah diadakan akreditasi program studi S1 di Fakultas Teknik Unsrat oleh Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT) Departemen Pendidikan Nasional RI, dimana program studi Arsitektur mendapat nilai B. Beberapa waktu kemudian berdasarkan SK.No.10490/SK/BAN-PT/AkPPJ/S/VIII/2021, Program Studi S1 Arsitektur terakreditasi A dengan peringkat Unggul yang masa berlakunya sampai dengan Tahun 2026 . Pada tahun 2022 program studi Arsitektur telah meningkat statusnya dengan kategori “Internasional”. Selanjutmnya Program Studi Perencanaan Wilayah dan Kota berdasarkan SK.No. 10834/SK/BAN-PT/AK-ISK/S/IX/2021 terakreditasi A dengan peringkat “Unggul” yang masa berlakunya sampai dengan Tahun 2024.